Задание 1

PDB-файлы, содержащие соответствующие формы ДНК:

A-форма

В-форма

Z-форма

Задание 2

Для аденина в сторону большой бороздки обращены атомы [DA]10:A.N7, [DA]10:A.C5, [DA]10:A.C6, [DA]10:A.N6(красные). В сторону малой бороздки обращены атомы [DA]10:A.N9, [DA]10:A.C4, [DA]10:A.N3, [DA]10:A.C2(синие).

Таблица 1. Параметры структуры A‑, B‑ и Z‑формы ДНК.

	A‑форма	B‑форма	Z‑форма
Тип спирали (правая или левая)	правая	правая	левая
Шаг спирали (Å)	29,8	31,5	43,5
Число оснований на виток	11	10	12
Ширина большой бороздки	14,52 ([DG]6:A.P – [DC]2:B.P)	16,72 ([DA]5:A.P – [DG]16:B.P)	7,20 ([DG]35:B.P – [DG]9:A.P)
Ширина малой бороздки	16,69 ([DG]6:A.P – [DG]13:B.P)	13,21 ([DA]5:A.P – [DG]24:B.P)	14,52 ([DC]34:B.P – [DC]10:A.P)

Задание 3

Координаты стеблей:

[1-7:72-66](акцепторный стебель), [49-53:65-61](T-стебель), [40-44:30-26](антикодоновый стебель), [10-13:25-22](D-стебель)

Неканонические пары оснований:

4-69; 54-58; 36-33; 38-32; 44-26; 14-8; 15-48

Водородные связи вне стеблей:

54-58; 36-33; 38-32; 14-8; 15-48; 19-56

Анализ