Практикум 10

На сайте NCBI Datasets были найдены геномы двух штаммов кишечной палочки(NZ_CP148331.1 и NZ_CP150075.1). С помощью BLAST были построены карты локального сходства (dot plot) по двум алгоритмам (megablast (верхнее фото) и blastn (нижнее фото)).

Разрывы линий связаны с наличием мутаций в геноме(делеций). Наличие двух линий(а не одной) связано с тем, что были по-разному выбраны точки начала секвенирования. Megablast и blastn выстроились одинаково, за исключением того, что в первом меньше шума