Был выбран домен: SIMPL ( Protein of unknown function (DUF541))
AC: PF04402
seed: 576
structures: 6
jvp
| Таблица 11-3 | Информация | Комментарии |
|---|---|---|
| Выравнивание seed | Число последовательностей: 576 Число колонок: 429 |
|
| МДБ-all | 1-16 | |
| МДБ-All 100% консервативные колонки | 5:G ; 14:D | Был выбран Color Clustal, above identity threshold. При параметре 100 консервативных колонок не было найдено, поэтому опустили до 75. |
| МДБ-notAll | Номер колонок:1-16 Последовательности: 19-29 |
100% консервативные колонки в МДБ-notAll | 1:V ; 3:V ; 5:G ; 7:G ; 9:V ; 11:G ; 13:P ; 14:D ; 16:L | Участок выравнивания, не отражающий ход эволюции. | 27-51 | В выравнивании много гэпов, нет консервтивных участков |