PFAM

Семейства белковых доменов SIMPL

Это семейство белков обнаружено у бактерий и мышей. Потенциальные гомологи также выявлены в транслируемых EST (экспрессируемый секвенированный идентификатор) крыс и человека. У мышей белок назван SIMPL – сигнальная молекула, ассоциированная с киназой mPLK. SIMPL регулирует образование комплекса IRAK/IKK. Полная информация представленна в таблице 12.1.

Таблица 12-1	Информация	Комментарии
AC pfam	PF04402
ID pfam	SIMPL
#SEED	576
#All	34 тыс.	Все белки с доменом семейства
#SW	12	Все белки с доменном в Swissprot
#architectures	46
#3D	3
	Taxonomy
#eukaryota	1572
#archaea	1282
#bacteria	30431

Карта локального сходства

Информация о последовательностях представленна в таблице 12.2

Таблица 12.2	Информация	Комментарии
Доменная архитектура 1	PF04402 - PF04402	147 белков
Белок с архитектурой 1	Q7UVD0	302АА
Доменная архитектура 2	PF04402 - PF00127 - PF04402	4 белка
Белок с архитектурой 2	A0A1Q7CXC1	478АА

**Рис.1** Координаты доменов. Доменная архитектура 1: PF04402 (53-138), PF04402 (162-293). Доменная архитектура 2: PF04402 (53-166), PF00127 (202-278), PF04402 (293-473)

Была построена карта локального сходства (рис. 2) двух последовательностях с одним и тем же доменом, но с разной доменной архитектурой.

**Рис.2** *карта (dotplot:* по вертикали Q7UVD0, по горизонтали A0A1Q7CXC1 при E-value: 0.05

Карта отражает общий домен между QTUVDB и ABAIQYCXC1, но их разная доменная архитектура проявляется в делеции, которая видна на карте локального сходства. Это может быть связано с перестройками в порядке доменов.