Задание 1

Задание 2

Сравнение цепей

Рисунок 1.Сгенерированная цепь B-ДНК

Рисунок 2. Цепь B-ДНК полученная экспериметальным путем

Сгенерированная программой структура является более конденсированной и симметричной, в отличие от структуры, полученной экспериментальным путем.

Большая и малая бороздки

Рисунок 3.Красными стрелками обозначено направление малой бороздки, а синими - большой.

Рисунок 4. Аденин.

В сторону малой бороздки обращены атомы: С2, С6, N1,N6. В сторону большой бороздки: N9, C8.

Форма	Тип спирали	Шаг спирали (Å)	Число оснований на виток	Ширина большой бороздки	Ширина малой бороздки
A-форма	правая	28	11	17.0(A/DA'10/P-B/DA'34/P)	8.0(A/DT'11/P-B/DC'24/P)
B-форма	правая	33	10	17.9(A/DG'5/P-B/DC'32/P)	11.7(A/DG'9/P-B/DC'36/P)
Z-форма	левая	40.4	12	9.9(A/DC'6/P-B/DG'19/P)	11.6(A/DC'10/P-B/DG'13/P)

Задание 3

Глутамил-тРНК-синтетаза (2CV1) - структура фермента, который присоединяет глутамат к тРНК.

Find pair Выдача
Координаты стеблей:
(501-507 и 572-566); (549-553 и 565-561); (538-544 и 532-526); (510-513 и 525-522)
Неканониические пары оснований
G502-U571; U555-G518; A538-C532; A544-G526; U513-G522; G502-U571
Дополнительные водородные пары
U554-A558; U555-G518; A538-C532; A544-G526; A514-U508; G515-C548;U554-A558